琼脂糖凝胶电泳配方与步骤(精)

2022-04-07 20:00:04   第一文档网     [ 字体: ] [ 阅读: ] [ 文档下载 ]
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RNA 琼脂糖凝胶电泳: 配制:

1. 0.5M EDTA(pH=8.0 :

100ml :称取 18.61g Na 2EDTA ·2H 2O (分子量 372.24 , 80ml ddH 2O 剧烈搅, NaOH 调节 PH 值至 8.0(约需 2g NaOH . 高压灭菌,室温保存。

2. 50×TAEloading buffer:(Tris acetate-EDTA buffer 电泳缓冲液 组分:2MTris-乙酸;100mM EDTA(pH=8.0

500mL: 121.1g Trisbase(分子量 121.14 , 800ml ddH 2O 溶解, 57.1ml 乙酸 50ml 0.5M EDTA 溶液(pH=8.0 ,搅拌, ddH 2O 定容至 500mL . 室温保存。

3. 1×TAEloading buffer:

20ml 50×TAE, ddH 2O 定容至 1L. 室温保存。 4. 100×Sybergreen :

500ul : 495ul 1×TAE 1.5ml 离心管,加入 5ul Sybergreen 原液混匀,4℃锡纸 避光保存。

注意:Sybergreen 原液需稀释 10000;

DNAloading buffer 上样缓冲液需稀释六倍,最终稀释倍数应不小于 步骤: 1. 制备 1%琼脂糖凝胶 (大胶用 70ml, 小胶用 50ml ,我们用 30ml:

0.3g 琼脂糖置于 100ml 锥形瓶中,加入 30ml 1×TAE ,瓶口倒扣小烧杯。 微波炉加热煮沸 3,至琼脂糖全部融化,摇匀,即成 1.0%琼脂糖凝胶液。

2. 胶板制备 :






取电泳槽内的有机玻璃内槽 (制胶槽 洗干净 , 晾干 , 放入制胶玻璃板 . 取透明胶带 将玻璃板与内槽两端边缘封好 , 形成模子 . 将内槽置于水平位置 , 并放好梳子 .

将冷却到 65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上 , 使胶液缓慢 展开 , 直到整个玻璃板表面形成均匀胶层 . 室温下静置直至凝胶完全凝固 , 垂直轻拔梳 , 取下胶带 , 将凝胶及内槽放入电泳槽中 . 添加TAE 电泳缓冲液至没过胶板为止 . 3. 加样 :

样品制备:(10ul 体系 /样品槽于 0.25ml 离心管中 样品 RNA (最后加 :2ul /3ul/5ul DNA loading buffer:10/6=1.7ul 100×Sybergreen :0.1ul DEPC : 10ul

(注意 :加样前要先记下加样的顺序 . 分别将样品加入胶板的样品小槽内 , 每加 一个样品 , 应更换一个枪头 , 以防污染 , 加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面 .

4. 电泳 :

加样后的凝胶板立即通电进行电泳 , 电压 60-100V , 样品由负极 (黑色 向正极 (红色 方向移动 . 电压升高 , 琼脂糖凝胶的有效分离范围降低 . 当溴酚蓝移动到距离胶板下沿 1cm 处时 , 停止电泳 .

5. 电泳完毕后 , 取出凝胶 , 利用科 212凝胶成像系统 , 在紫外灯(trans UV 下观察拍照 保存 .DNA 存在则显示出红色荧光条带 . RNA 完美提出应该是三条带:28, 18, 5.8 28 18比较亮 , 而且 28 18亮度的 2 ,5.8基本很模糊,可有可无




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